Building integrated plant health surveillance: a proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence - Oniris
Article Dans Une Revue (Article De Synthèse) CABI Agriculture and Bioscience Année : 2024

Building integrated plant health surveillance: a proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence

S. Soubeyrand (1) , Arnaud Estoup (2) , Astrid Cruaud (2) , Sylvie Malembic-Maher (3) , Christine Meynard (2) , Virginie Ravigné (4) , Marc Barbier (5) , Benoit Barrès (6) , Karine Berthier (7) , Simon Boitard (2) , Sylvie Dallot (4) , Sabrina Gaba (8) , Marie Grosdidier (1) , Mourad Hannachi (9) , Marie-Agnès Jacques (10) , Melen Leclerc (11) , Philippe Lucas (12) , Davide Martinetti (1) , Christophe Mougel (11) , Corinne Robert (13) , Alain Roques (14) , Jean-Pierre Rossi (2) , Frédéric Suffert (15) , Pierre Abad (16) , Marie-Anne Auger-Rozenberg (14) , Jean-Sauveur Ay (17) , Marc Bardin (7) , Hélène Bernard (18) , David Bohan (19) , Thierry Candresse (3) , Philippe Castagnone-Sereno (16) , Etienne Danchin (20) , Chloe E. L. Delmas (21) , Pauline Ezanno (22) , Frédéric Fabre (21) , Benoît Facon (2) , Edith Gabriel (1) , Jonathan Gaudin (7) , Bertrand Gauffre (23) , Mathieu Gautier (2) , Claire Guinat (24) , Claire Lavigne (23) , Olivier Lemaire (25) , César Martinez (1) , Lucie Michel (1) , Benoît Moury (7) , Kiwoong Nam (26) , Claire Nédellec (27) , Mylène Ogliastro (26) , Julien Papaïx (1) , Nicolas Parisey (11) , Sylvain Poggi (11) , Andrea Radici (1) , Jean-Yves Rasplus (2) , Xavier Reboud (19) , Cecile Robin (28) , Mathieu Roche (29) , Adrien Rusch (21) , Nicolas Sauvion (4) , Jean‐Claude Streito (2) , Eric Verdin (7) , Anne-Sophie Walker (15) , Anne Xuéreb (2) , Gaël Thébaud (4) , Cindy E. Morris (7)
1 BioSP - Biostatistique et Processus Spatiaux
2 UMR CBGP - Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
3 BFP - Biologie du fruit et pathologie
4 UMR PHIM - Plant Health Institute of Montpellier
5 LISIS - Laboratoire Interdisciplinaire Sciences, Innovations, Sociétés
6 CASPER - CAractérisation et Suivi des Phénomènes d'Evolution de Résistance aux pesticides
7 PV - Unité de Pathologie Végétale
8 CEBC - Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372
9 SADAPT - Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires
10 IRHS - Institut de Recherche en Horticulture et Semences
11 IGEPP - Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes
12 iEES Paris - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
13 ECOSYS - Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes
14 URZF - Zoologie forestière
15 BIOGER - BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture
16 ISA - Institut Sophia Agrobiotech
17 CESAER - Centre d'économie et de sociologie rurales appliquées à l'agriculture et aux espaces ruraux
18 LABERCA - Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
19 Agroécologie [Dijon]
20 INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
21 UMR SAVE - Santé et agroécologie du vignoble
22 BIOEPAR - Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale
23 PSH - Plantes et systèmes de culture horticoles
24 IHAP - Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse]
25 SVQV - Santé de la vigne et qualité du vin
26 DGIMI - Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier]
27 MaIAGE - Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas]
28 BioGeCo - Biodiversité, Gènes & Communautés
29 UMR TETIS - Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale
S. Soubeyrand
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Biostatistique et Processus Spatiaux
Arnaud Estoup
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
CV
Astrid Cruaud
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
Sylvie Malembic-Maher
Biologie du fruit et pathologie
Christine Meynard
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
Virginie Ravigné
Plant Health Institute of Montpellier
Marc Barbier
Laboratoire Interdisciplinaire Sciences, Innovations, Sociétés
CV
Benoit Barrès
CAractérisation et Suivi des Phénomènes d'Evolution de Résistance aux pesticides
Karine Berthier
Unité de Pathologie Végétale
Simon Boitard
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
Sylvie Dallot
Plant Health Institute of Montpellier
Sabrina Gaba
Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372
Marie Grosdidier
Biostatistique et Processus Spatiaux
Mourad Hannachi
Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires
CV
Marie-Agnès Jacques
Institut de Recherche en Horticulture et Semences
Melen Leclerc
Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes
CV
Philippe Lucas
Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
CV
Davide Martinetti
Biostatistique et Processus Spatiaux
CV
Christophe Mougel
Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes
CV
Corinne Robert
  • Fonction : Auteur
Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes
Alain Roques
Zoologie forestière
CV
Jean-Pierre Rossi
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
CV
Frédéric Suffert
BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture
CV
Pierre Abad
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1401627
  • IdHAL : pierre-abad
Institut Sophia Agrobiotech
Marie-Anne Auger-Rozenberg
Zoologie forestière
CV
Jean-Sauveur Ay
Centre d'économie et de sociologie rurales appliquées à l'agriculture et aux espaces ruraux
Marc Bardin
Unité de Pathologie Végétale
CV
Hélène Bernard
Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
David Bohan
Agroécologie [Dijon]
CV
Thierry Candresse
Biologie du fruit et pathologie
Philippe Castagnone-Sereno
Institut Sophia Agrobiotech
CV
Etienne Danchin
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
CV
Chloe E. L. Delmas
Santé et agroécologie du vignoble
CV
Pauline Ezanno
Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale
CV
Frédéric Fabre
Santé et agroécologie du vignoble
CV
Benoît Facon
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
Edith Gabriel
Biostatistique et Processus Spatiaux
Jonathan Gaudin
Unité de Pathologie Végétale
CV
Bertrand Gauffre
Plantes et systèmes de culture horticoles
CV
Mathieu Gautier
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
Claire Guinat
Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse]
Claire Lavigne
Plantes et systèmes de culture horticoles
CV
Olivier Lemaire
Santé de la vigne et qualité du vin
César Martinez
  • Fonction : Auteur
Biostatistique et Processus Spatiaux
Lucie Michel
  • Fonction : Auteur
Biostatistique et Processus Spatiaux
Benoît Moury
Unité de Pathologie Végétale
CV
Kiwoong Nam
Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier]
Claire Nédellec
Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas]
Mylène Ogliastro
Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier]
CV
Julien Papaïx
Biostatistique et Processus Spatiaux
CV
Nicolas Parisey
Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes
CV
Sylvain Poggi
Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes
CV
Andrea Radici
Biostatistique et Processus Spatiaux
Jean-Yves Rasplus
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
Xavier Reboud
Agroécologie [Dijon]
Cecile Robin
Biodiversité, Gènes & Communautés
Mathieu Roche
Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale
Adrien Rusch
Santé et agroécologie du vignoble
CV
Nicolas Sauvion
Plant Health Institute of Montpellier
CV
Jean‐Claude Streito
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
Eric Verdin
Unité de Pathologie Végétale
Anne-Sophie Walker
BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture
Anne Xuéreb
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
CV
Gaël Thébaud
Plant Health Institute of Montpellier
Cindy E. Morris
Unité de Pathologie Végétale
CV

Résumé

In an era marked by rapid global changes, the reinforcement and modernization of plant health surveillance systems have become imperative. Sixty-five scientists present here a research agenda for an enhanced and modernized plant health surveillance to anticipate and mitigate disease and pest emergence. Our approach integrates a wide range of scientific fields (from life, social, physical and engineering sciences) and identifies the key knowledge gaps, focusing on anticipation, risk assessment, early detection, and multi-actor collaboration. The research directions we propose are organized around four complementary thematic axes. The first axis is the anticipation of pest emergence, encompassing innovative forecasting, adaptive potential, and the effects of climatic and cropping system changes. The second axis addresses the use of versatile broad-spectrum surveillance tools, including molecular or imaging diagnostics supported by artificial intelligence, and monitoring generic matrices such as air and water. The third axis focuses on surveillance of known pests from new perspectives, i.e., using novel approaches to detect known species but also anticipating and detecting, within a species, the populations or genotypes that pose a higher risk. The fourth axis advocates the management of plant health as a commons through the establishment of multi-actor and cooperative surveillance systems for long-term data-driven alert systems and information dissemination. We stress the importance of integrating data and information from multiple sources through open science databases and metadata, alongside developing methods for interpolating and extrapolating incomplete data. Finally, we advocate an Integrated Health Surveillance approach in the One Health context, favoring tailored and versatile solutions to plant health problems and recognizing the interconnected risks to the health of plants, humans, animals and the environment, including food insecurity, pesticide residues, environmental pollution and alterations of ecosystem services.

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Phytopathologie et phytopharmacie Analyse de données, Statistiques et Probabilités [physics.data-an]
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Soumis le : lundi 26 août 2024-13:24:32

Dernière modification le : mardi 19 novembre 2024-14:58:03

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S. Soubeyrand, Arnaud Estoup, Astrid Cruaud, Sylvie Malembic-Maher, Christine Meynard, et al.. Building integrated plant health surveillance: a proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence. CABI Agriculture and Bioscience, 2024, 5, pp.72. ⟨10.1186/s43170-024-00273-8⟩. ⟨hal-04672656⟩

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